南京师范大学MBA教育中心是在南京师范大学MBA教育指导委员会的领导、研究生部的业务指导下进行MBA专业学位教育的培养与管理机构，挂靠商学院。南京师范大学MBA教育中心下设办公室、招生推广部、教学管理部、就业指导与事业发展部、项目拓展部等部门。南京师范大学MBA教育中心拥有核心课程的教师39人，师资队伍呈高职称、高学历和富有实践经验等特征。