南昌航空大学设有非全日制研究生学院如下：材料科学与工程学院、环境与化学工程学院、信息工程学院、外国语学院、经济管理学院、体育学院、土木建筑学院、艺术与设计学院、马克思主义学院、文法学院、音乐学院、软件学院等。

2022年，南昌航空大学非全日制研究生费用收取情况如下：土木建筑学院，交通运输学费：3.6万。航空制造工程学院，材料科学与工程学费：1.28万。马克思主义学院，马克思主义理论学费：1.28万。艺术设计学院，艺术设计学费：2.4万。土木建筑学院，土木工程学费：1.28万、工程管理（MEM）学费：2.4万。文法学院，广播电视学费：2.4万。

南昌航空大学非全日制研究生毕业时，学校根据其修业年限、学业成绩等，均按照国家有关规定发给相应的、注明学习方式的毕业证书；其学业水平达到国家规定的学位标准，可以申请授予相应的学位证书。全日制和非全日制研究生实行相同的考试招生政策和培养标准，其学历学位证书具有同等法律地位和相同效力。