重庆交通大学理学院前身为重庆交通学院基础部，由于学科专业发展需要，1993年更名“重庆交通学院基础科学系”，1996年更名“重庆交通学院计算机及信息工程系”，2003年10月成立“重庆交通学院基础部”，2006年7月正式成立“重庆交通大学理学院”。

重庆交通大学理学院在职研究生招生简章

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